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公司動態(tài)

如何提高蛋白質(zhì)的表達(dá)量?

閱讀:133          發(fā)布時(shí)間:2021-7-22

相信如何提高目的重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)量是很多同學(xué)在研究中都會遇到的問題。泡了無數(shù)論壇,看了無數(shù)帖子,嘗試過IPTG的誘導(dǎo)濃度、培養(yǎng)基成分、誘導(dǎo)溫度、誘導(dǎo)時(shí)間,甚至讓別的公司幫忙做密碼子優(yōu)化(將目的片段通過全基因合成的方式合成出來)??偟膩碚f,提高IPTG濃度是可以提高目的蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)量的,但一般也就用到1mM的濃度,再高對細(xì)胞有毒性; 培養(yǎng)基營養(yǎng)越豐富,表達(dá)量越高,所以如果追求表達(dá)量的話,就不要用LB培養(yǎng)基了,用自動誘導(dǎo)培養(yǎng)基吧; 誘導(dǎo)溫度,溫度越低表達(dá)量越低,但是可溶的比例一般來說會越高,所以如果追求表達(dá)量可以嘗試37℃或者42℃(沒試過42℃);誘導(dǎo)時(shí)間,這個(gè)跟培養(yǎng)基成分及供氧情況很有關(guān)系,如果供氧不足/營養(yǎng)不夠,提高時(shí)間會起到反效果。



綜合而言,一般用的重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件是固定的,有時(shí)候要追求可溶表達(dá),頂多就調(diào)整下誘導(dǎo)溫度(25℃)。條件就是:自動誘導(dǎo)培養(yǎng)基(不用額外的IPTG),37℃,20h。一般來說大分部蛋白的表達(dá)量都還可以。

但有些蛋白的表達(dá)量不行,或者某些蛋白需要長期大量使用,因此提高這些重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)量就十分有必要了,如果進(jìn)一步提高呢?

我們都知道,蛋白質(zhì)的表達(dá)量和蛋白質(zhì)的翻譯效率有關(guān),翻譯效率又跟mRNA的二級結(jié)構(gòu)又有關(guān)系,如果mRNA形成了復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu),會導(dǎo)致核糖體無法順暢的將整個(gè)mRNA讀通,甚至?xí)崆皬膍RNA上掉下來。一般公司號稱的密碼子優(yōu)化,也就是通過替換掉一些稀有密碼子,顯然如果不從二級結(jié)構(gòu)上考慮的話,是沒法提高蛋白質(zhì)的表達(dá)量的,而事實(shí)也確實(shí)如此。在公司做研發(fā)的幾年中,做過多個(gè)蛋白的密碼子優(yōu)化(通過全基因合成的方式),結(jié)果差強(qiáng)人意。

今天介紹的方法,不是從二級結(jié)構(gòu)上來預(yù)測的(據(jù)我所知,目前沒有比較準(zhǔn)確的方法來預(yù)測mRNA的二姐結(jié)構(gòu)),而是一種簡單、高效的方法:通過優(yōu)化目的基因的5'部分DNA序列,而且不需要通過軟件預(yù)測,*隨機(jī),包含所有可能(理論上),且不改變氨基酸序列。

原理:蛋白質(zhì)的翻譯效率很大程度上跟翻譯起始效率有關(guān),因此mRNA的5'端必須得很好翻譯,最好不要有復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu);通過PCR的方法在基因的5‘端引入簡并序列,構(gòu)建克隆,挑選多個(gè)克隆,誘導(dǎo)表達(dá)之,SDS-PAGE電泳檢測表達(dá)量的高低,挑選高表達(dá)克隆進(jìn)行測序。

實(shí)驗(yàn)步驟:
1.設(shè)計(jì)目的重組蛋白質(zhì)的N端10-15個(gè)氨基酸的簡并序列。
2.引物合成上述簡并序列,同時(shí)設(shè)計(jì)合成目的基因反向引物。
3.PCR擴(kuò)展目的基因,這樣在目的基因的5‘端就引入了兼并序列,同時(shí)不改變氨基酸序列。
4.雙酶切,插入到目標(biāo)載體。
5.轉(zhuǎn)化。
6.挑選多個(gè)克?。ū热?00-200個(gè))到1.5ml EP管,直接誘導(dǎo)表達(dá)(記得帶上為改造克隆菌株的對照)。
7.SDS-PAGE檢測。
8.挑選高表達(dá)的多個(gè)克隆,測序。

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